① HIV感染及其致病机理：主要关注HIV-1潜伏感染状态下的基因表达，特别是miRNA表达谱与基因表达谱的交互作用。细胞miRNA调控大量基因，参与病毒感染及宿主抗病毒过程，潜伏感染或持续性感染状态下，细胞miRNA与细胞的基因、病毒自身基因存在大量互作，并保持一定的平衡。目前“HIV-1自身编码的miRNA参与HIV-1感染及致病机制研究”获得国家自然科学基金等资助。
② 利用小分子调控病毒复制：主要目标是尝试利用多肽、小分子RNA等干扰病毒感染和复制。病毒吸附、基因组复制转录、包括转录本切割等多个步骤均涉及小分子参与，可利用关键分子进行病毒复制抑制干预和复制增强干预。
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